Né à Bienne le 20 novembre 1964, Jean-Christophe Geiser fait ses études musicales au Conservatoire de Berne où il obtient en 1989 un diplôme de piano dans la classe d'Otto Seger et un diplôme de soliste avec félicitations du jury dans la classe d'orgue d'Heinrich Gurtner. Il remporte à deux reprises le prix de la Fondation Göhner, qui lui permet de se perfectionner à Paris avec François-Henri Houbart, et de suivre différents cours d'interprétation. Parallèlement à ses études au Conservatoire, Jean-Christophe Geiser étudie la musicologie et le droit à l'Université de Berne, et obtient son brevet d'avocat.

En 1991, Jean-Christophe Geiser est nommé organiste titulaire de la cathédrale de Lausanne où il succède à André Luy. Il est également professeur d'orgue à la Haute école de musique de Lausanne depuis 1993 et doyen des classes professionnelles d'orgue et de clavecin. Il est aussi directeur artistique de la Société des concerts de la Cathédrale.Il poursuit en outre une carrière de concertiste sur la scène internationale puisqu'il a eu l’occasion de se produire dans plus d'une trentaine de pays, notamment en Allemagne, Suède, Belgique, France, Etats-Unis, Angleterre, Russie, Pologne et Brésil. Il a réalisé de nombreux enregistrements pour différentes radios suisses, mais aussi DeutschlandRadio, Südwestfunk, Radio Russie et pour les labels VDE-GALLO, IFO-Verlag et FNAC-Musique.Il est à l'origine de la conception des nouvelles orgues Fisk de la Cathédrale de Lausanne, inaugurées en décembre 2003. Il s’agit du plus grand instrument de musique de Suisse, d’une conception encore inédite puisqu’il rassemble les quatre options principales de la facture d’orgue: classique française, baroque allemande, symphonique française et romantique allemande. Il s’agit également du premier instrument dessiné par un designer, Giorgetto Giugiaro.
Jean-Christophe Geiser est membre de l'Institut jurassien des sciences, des lettres et des arts (IJSLA) et vit actuellement à Lausanne.

sites mentionés; 24 Heures, 2002/10/21, p. 26 avec photographie; Souffles, Musiques et orgues à la cathédrale de Lausanne, p. 155; Jean-Christophe Geiser aux grandes orgues Fisk de la Cathédrale de Lausanne, CD et booklet, Disque VDE-GALLO, 2005 [BCULMU06/BCUL/MU/bru/2012/09/10]

L'école d'orgue moderne française. A propos des organistes et compositeurs Marcel Dupré, Rolande Falcinelli et Jean Guillou (4/5) : Le concert d'orgue, un concert comme les autresDate: 28.09.2006Int./Part.: Geiser, Jean-Christophe; Rieder, Jean-Luc; Falcinelli, SylvianeEmission : Musique en mémoireMinutage: 0:54:05
Un nouvel orgue pour la cathédrale de Lausanne (1/5)Date: 08.12.2003Int./Part.: Zibung, Philippe; Geiser, Jean-Christophe; Barrelet, AlexandreEmission : Mémoires de la musiqueMinutage: 0:57:33
Un nouvel orgue pour la cathédrale de Lausanne (2/5)Date: 09.12.2003Int./Part.: Zibung, Philippe; Barrelet, Alexandre; Geiser, Jean-ChristopheEmission : Mémoires de la musiqueMinutage: 0:57:21